Un virus est un agent infectieux submicroscopique qui se réplique uniquement à l’intérieur des cellules vivantes d’un organisme. Ils ne sont pas considérés comme réellement vivants car ils ne disposent pas de la machinerie cellulaire nécessaire à une vie indépendante. Au lieu de cela, ils détournent les mécanismes cellulaires de leur hôte pour se reproduire, transformant essentiellement la cellule hôte en usine à virus. Les virus sont constitués de matériel génétique (ADN ou ARN) enfermé dans une enveloppe protéique appelée capside, et parfois d'une enveloppe lipidique supplémentaire.
Les virus sont classés de plusieurs manières, mais il n’existe pas de système unique universellement accepté. Voici quelques façons courantes de les classer :
1. En fonction du type de matériel génétique :
* Virus à ADN : Ces virus ont l’ADN comme matériel génétique. Les exemples incluent les herpèsvirus (causant les boutons de fièvre et la varicelle), les adénovirus (causant des infections respiratoires) et les poxvirus (causant la variole).
* Virus à ARN : Ces virus ont l’ARN comme matériel génétique. Il s’agit d’un groupe plus vaste et plus diversifié. Les exemples incluent les rétrovirus (comme le VIH), les virus de la grippe, le coronavirus (comme le SRAS-CoV-2, le virus responsable du COVID-19) et le virus de la rage. Les virus à ARN sont en outre classés en fonction de leur stratégie de réplication (par exemple, sens positif, sens négatif, etc.).
2. En fonction du type d'hôte qu'ils infectent :
* Virus bactériens (bactériophages) : Ces virus infectent les bactéries. Ils sont incroyablement abondants dans l’environnement et sont explorés pour des utilisations thérapeutiques potentielles (phagothérapie).
* Virus animaux : Ces virus infectent les animaux, dont les humains. Il s’agit d’un groupe très vaste et diversifié englobant bon nombre des virus mentionnés ci-dessus.
* Virus végétaux : Ces virus infectent les plantes, provoquant souvent d'importantes pertes agricoles.
* Virus fongiques (Mycovirus) : Ces virus infectent les champignons.
3. En fonction de leur structure :
* Virus hélicoïdaux : Ces virus ont une forme en forme de bâtonnet ou de filament. Les exemples incluent le virus de la mosaïque du tabac et certains virus de la grippe.
* Virus icosaédriques : Ces virus ont une forme à peu près sphérique avec 20 faces triangulaires. De nombreux virus, comme les adénovirus et les herpèsvirus, ont cette structure.
* Virus enveloppés : Ces virus sont entourés d'une enveloppe lipidique dérivée de la membrane de la cellule hôte. Cette enveloppe contient souvent des protéines virales qui aident le virus à pénétrer dans de nouvelles cellules hôte. Les exemples incluent les virus de la grippe, le VIH et les coronavirus.
* Virus complexes : Ces virus ont des structures plus complexes qui ne rentrent pas parfaitement dans les catégories hélicoïdales ou icosaédriques. Les bactériophages sont souvent considérés comme des virus complexes.
4. En fonction de leur cycle de réplication :
Les virus ont différentes stratégies pour se répliquer au sein de leurs cellules hôtes. Certaines se reproduisent rapidement, tandis que d’autres ont des cycles de vie plus complexes. Les détails de ces cycles de réplication sont assez techniques et varient considérablement selon les différents types de virus.
Il est important de se rappeler qu’il s’agit d’un aperçu simplifié. La classification des virus est un domaine complexe et en évolution, avec la découverte de nouveaux virus et le développement constant de nouvelles classifications. Les relations entre les différents virus sont souvent très complexes et certains virus défient toute catégorisation facile.
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